AbMol精研抑制剂十年，最新的科研动态不断与您分享。本期与您分享的是：长链非编码基因在抗癌药物反应中的生物学相关性。
长链非编码（lnc）RNA是一类引人入胜的转录物，但仍然存在很大争议，这主要是由于这些RNA的整体生物学相关性存在歧义。不幸的是，显示lncRNA功能的大量反向遗传学研究基于的分析要么受非特异性效应困扰，要么不能明确地将观察到的表型分配给转录本身。本研究中展示了新颖的CRISPR/Cas13 RNA敲减系统的应用，该系统具有比其他转录物靶向敲除方法（如RNAi）更高的特异性。基于对抗癌药物治疗的生存挑战，在高通量表型分析中将这种方法应用于新型的核lncRNA的广泛亚类-很长的基因间非编码（vlinc）RNA。使用了多层控制，包括针对每个靶向gRNA的错配控制，以确保揭示真正的表型-转录本关系。研究发现有证据支持多达60％的测试蛋白编码mRNA和重要的64％vlincRNA对细胞存活至关重要。总的来说，这项研究证明了CRISPR/Cas13作为一种高度敏感的特异性工具，可用于蛋白质编码基因和lncRNA的反向遗传学研究。此外，重要的是，该方法提供了支持后者转录物在抗癌药物反应中的生物学意义的证据。
Imatinib（Abmole，M3241，纯度99.48%），Mirin（Abmole，M5138，纯度98.64%%），Etoposide（Abmole，M2326，纯度99.39%），均用于处理细胞，进行细胞存活检测。
Figure 3. Time course of the survival challenge.
结果表明，与etoposide引起的最明显的瓶颈效应相一致，这种处理产生的基因文库具有最低的gRNA序列复杂性，其中27％的gRNA序列从人群中丢失，而 imatinib和mirin处理分别减少了1％和3％。
鸣谢：DongyangXu, et al. Sci Rep. 2020 Feb 4;10(1):1794.