JM109(DE3)大肠杆菌表达菌
JM109(DE3)大肠杆菌表达菌源自于JM109,它含有T7RNA聚合酶基因的染色体拷贝。如果克隆至载体上的基因包含了核糖体结合位点，JM109(DE3)就可以对位于T7启动子下游的基因序列进行高水平的表达。
C43(DE3)pLysS大肠杆菌表达菌
C43(DE3)pLysS大肠杆菌表达菌是一个大肠杆菌表达菌株，抗性是氯霉素Chl，可用LB，37℃培养。C43(DE3)菌株起源于 BL21(DE3) ，其优点是可以高效表达毒性蛋白或疏水性蛋白。
XL2-Blue大肠杆菌克隆菌
XL2-Blue大肠杆菌克隆菌来源于XL1-Blue菌株，为Hte(high transformation efficiency)基因型，Hte是Stratagene开发的特异性提高感受态转化效率及大质粒转化能力的宿主菌基因型，已成功应用于
BL21pLysS(DE3)大肠杆菌表达菌
BL21pLysS(DE3)大肠杆菌表达菌来源于BL21 (DE3)大肠杆菌。DE3是溶源性的λDE3, 所以带有T7 RNA聚合酶的染色体拷贝。该菌株适用于pET系列载体，及其他T7启动子系列载体。
Origami B(DE3)pLysS大肠杆菌表达菌
Origami B(DE3)pLysS大肠杆菌表达菌在trxB和gor中，“折纸”B型宿主携带的突变与最初的“折纸”菌株一样，只不过它们是由BL21的一种乳系突变体衍生而来的，通过调节IPTG的浓度，可以对表达水平进行精确控制。
Top10F'大肠杆菌克隆菌
Top10F'大肠杆菌克隆菌非常类似于DH10B和含有lacIq和Tn10的F质粒 虽然DH10B被传统地报道为galU galK，但DH10B的初步基因组序列表明，DH10B(以及他们的血统，还有TOP10和其他MC1061衍生品)实际上
Stbl3大肠杆菌克隆菌
Stbl3大肠杆菌克隆菌来源于 HB101 E. coli strain，是慢病毒载体系统推荐使用的菌株。基因组含有重组酶recA13突变，可有效抑制长片段末端重复区的重组，降低错误重组的概率；但不含核酸酶endA1突变，体内核酸酶含量较高
X33毕赤酵母菌
X33毕赤酵母菌一般的针对原核生物的抗生素例如卡那和氨苄对酵母是无效的，因此为了防止大肠杆菌等原核生物对酵母培养菌株污染，往往会在培养基中加入一些氨苄和卡那霉素的抗生素，来抑制细菌菌的污染和生长。