高灵敏度支原体qPCR检测试剂盒说明书(探针法）

【产品规格】

BPMPro100  100 Reactions/盒

【产品说明】

支原体(Mycoplasma)：目前发现的最小原核生物，据统计约15~35% 的细胞被支原体污染。支原体污染会改变宿主细胞的结构与功能，易致实验结果不稳定，须对培养细胞定期进行支原体检测。

本试剂盒采用多套引物探针在FAM通道检测支原体DNA，采用一套引物探针在HEX通道检测内参DNA，检测对象为细胞培养的上清液，细胞沉淀或其他生物制品。该试剂盒具有以下特点：

灵敏：配合推荐使用的核酸抽提方案，检测灵敏度达到10CFU/mL。

可靠：抽提加入内标核酸，全过程质量控制。

稳定：全程闭管操作，无交叉污染。

方便：操作简单，无需电泳步骤。

【有效期】

规定储存条件下6个月。

-20 ℃取出后，可避光存放于4 ℃继续使用1周。

【产品组分】

表1   产品组分

注：

1、阳性质控含有支原体DNA和内标DNA。

2、内部质控含有内标DNA。

在实验前请完整阅读本说明书，务必重视注意事项和无菌操作规范！

【操作步骤】

1.样本制备

（1） 样本的标准制备方案：请配合使用高效无微生物污染的DNA抽提试剂盒提取样本DNA。整个过程需要遵守无菌操作规范。本公司目前推荐抽提试剂盒见附录3。直接取20 µL待测样本DNA，作为模板进行 qPCR 反应。

（2） 前处理阴性样本准备方案：将RNase Free Water当成样本，加入内部质控，进行核酸抽提。

1. qPCR 反应液的准备

（1） 根据所要检测样品的数量，计算所需反应孔数，每个样本做3个重复孔。

反应孔数=1个阳性PCR质控+1个阴性PCR质控+1个前处理阴性质控+样本数× 3

（2） 根据反应孔数计算所需的qPCR Mix 总量（需有1孔的加样损失量）：

  Mix =（反应孔数+1）×10 μL

（3） 各试剂放室温融化，并根据下表所示准备 qPCR Mix：

表2  qPCR Mix的配制

2. 加样

（1）震荡混匀 qPCR Mix，低速离心，将管盖残留液体收集至管底。

（2）向每孔反应管中分装 10 μL qPCR Mix。

（3）向已分装过 qPCR Mix 的反应管中加入15 μL石蜡油。

（4）向反应管中加入样品后短暂离心，加样示例如下：

表 3 加样示例   

【注】：此时每个反应孔的体积为30 μL。

qPCR 阴性的PCR模板为20 μL RNase Free Water。

PCR 仪设置以 ABI 7500 为例，相对定量模式，选择TaqMan 探针法：

注：1、该程序为两阶段扩增法，如荧光定量PCR仪可以两阶段收集荧光，按照正常Ct值判断结果；如果只能最后一步收集荧光，需要在原数据的基础上加15个Ct值。

2、ROX设置是以7500为例，但也存在例外，例如StepOne。

【阈值设置】

以ABI 7500 为例，扩增曲线选择 log 法，如果不能两阶段收集荧光，基线设置1~2个循环；如果可以，基线设置3-15个循环。建议用 log 法扩增曲线保证结果稳定可靠。

（1） 内参(HEX/VIC)阈值设定：以阳性对照定内参扩增曲线阈值，将内参的Ct 值定为 28±2。

（2） 支原体(FAM)阈值设定：以阳性对照定支原体扩增曲线阈值，将支原体(FAM)的 Ct 值定为 28±2 。

【实验质量控制】：

如果阳性对照管的支原体(FAM)Ct 值>30，但阳性对照管及前处理阴性对照管的内参(HEX)Ct 值正常，表明阳性支原体对照模板有降解。

如果样品前处理阴性的内参（HEX/VIC)Ct 值>30，阳性对照管的内参(HEX)Ct 值>30 ，表明内参DNA存在降解或PCR体系扩增效率下降。

【结果判读】

根据支原体(FAM) Ct 值、内标(VIC) Ct 值判定，具体标准如下：

要求每个检测样品做3重复，如果3复孔中，两重复为阳性，则判读为阳性；建议做样本前处理阴性，可以质控整个抽提过程。

注：检测结果异常时：

1. 样品前处理阴性：内参Ct值过大，表明抽提效率低；支原体检测通道Ct值小于37.5，可能前处理抽提过程存在污染。

2. qPCR阴性：支原体和内参检测通道Ct值小于37.5，操作过程存在污染。

3. 样本前处理阴性质控和PCR阳性质控内参差1±1个Ct值属于正常现象。

【 PCR过程注意事项】

由于 PCR 反应非常灵敏，实验操作中应注意以下事项，以免发生DNA 污染：

1．试剂盒开启后，阳性质控和内部质控与试剂Biowing® MyqPCR Reaction Mix1、Biowing®MyPrimer&Probe Mix2、RNase Free Water、石蜡油分开存放。

2．每个组分在使用前都应先低速离心后小心开启。使用时请上下轻柔颠倒十次混匀，避免起泡，并低速短暂离心后使用。

3．要求核酸抽提和qPCR过程都符合无菌操作规范。

4．建议自备转运盒，用于将配制分装好的Mix从配置Mix超净工作台转运到加样超净工作台。

5．建议在 qPCR 反应板上阳性对照的排布应远离待测样本和阴性对照。

6．建议 qPCR 配置与分装在一个无菌操作台，样本的加样在另外一个无菌操作台。

7．建议使用不同的移液器添加阳性对照与待测样本、阴性对照，并使用带滤芯的枪头进行加样。

8．应按照先加阴性，再加样本，最后加阳性的顺序加样。且阳性用专门的加样器。建议阳性在专门的无菌操作台加样。

9．qPCR 反应板封膜或盖盖子时须反复压紧。

10．上机扩增前，反应管短时低速离心，将管壁液体收集至管底

11．盖上反应管盖子或者贴上光学膜后，为避免影响荧光信号读取，请注意不要在管盖或者膜上做标记，或者用刮板反复摩擦。

12．本产品仅作科研用途。

【附录 1 可检测支原体种类】

【附录 2 适用荧光定量 PCR 仪品牌型号】

注：适用荧光定量PCR 仪为迄今为止我们客户配备的定量仪器品牌型号，如您的荧光定量 PCR 仪不在我们列出的范围，也欢迎联系我们，申请试用。

如有技术问题，欢迎电话咨询：021-33559491

【附录 3 样本前处理和抽提方案】

为了检测灵敏度达到10CFU/mL，起始量为2mL及以上。

在实验前请完整阅读本说明书，务必重视注意点！

样本前处理

实验准备

阴性对照（NCS）：每次实验中都需要用稀释液设置一个 NCS 作为对照样品，NCS 与其他待测样品一起进行 DNA 的提取和纯化操作，以评估在样品处理过程中各操作步骤是否正确，是否存在样品交叉污染或环境污染的情况。

制备步骤如下：取 1.5 mL 无菌低吸附离心管，加入无菌水（具体根据抽提方案调整），再加入6 μLIC，混匀。

待测样品：在提取支原体样品之前将 IC 添加到样品中，可以作为整个实验过程的质控。制备步骤如下：取 1.5 mL 无菌低吸附离心管，根据不同抽提方案上样量调整离心浓缩后体积，再加入 6 μL IC，混匀。

样品处理

离心浓缩

• 取离心去除细胞后的上清，于  4 ℃ 15000 rpm 离心  10      min，沉淀支原体颗粒。

• 离心后，小心用移液枪缓慢吸出上清。注意吸取速度不可太快，枪头不可触碰支原体沉淀颗粒。切忌采用直接倾倒的方式去除上清，以免造成损失。

• 加入裂解液（具体根据抽提方案调整），用移液枪吹打或涡旋重悬支原体沉淀，并轻微离心， 将管壁等上面的液滴离心下来。

注意样品预处理好后需尽快进行下述的DNA 提取实验

抽提方案

样品可手工抽提，也可机器抽提。已测试过的手工抽提试剂盒、机器抽提试剂盒和配套仪器具体货号和型号如下：

手工抽提：

1）QIAGEN公司的QIAamp UCP Pathogen Mini Kit (50)，货号： 50214；抽提上样量400 uL。

2）天根公司的细菌基因组DNA提取试剂盒（50 preps），货号：DP302；抽提上样量200 uL。

机器抽提：

1）济凡公司的FineQuick 快速磁珠法大体积血液基因组提取试剂盒（48次），货号：M104T，机器型号：Purifier HT；抽提上样量2mL。

2）Genolution公司的NX Bacterial DNA Kit，货号：CBD296，机器型号：NX-48；抽提上样量200 uL。

核酸抽提注意事项

Ø 请尽量在完成样品纯化处理当天进行后续的 DNA 检测，以保证检测结果的准确性。

Ø 请离心浓缩完马上开始DNA抽提，以保证检测结果的准确性。

Ø 手抽提取纯化操作过程建议在二级生物安全实验室或安全柜中进行。

手抽样品制备期间:

Ø 小心地将样品溶液加到核酸吸附柱上。枪头中的样品进入核酸吸附柱而不湿润柱的边缘。

Ø 不同液体在转移之间更换枪头。使用带滤芯的枪头。

Ø 避免用枪头接触核酸吸附膜。

【附录 4 相关设备耗材】

实验所需但试剂盒中未含材料

Ø RNase Free Water

Ø 无水乙醇（分析纯）

Ø PCR 8 连管或 96 孔板，相应管盖或覆膜

Ø 1000μL，100μL，10μL 无菌低吸附滤芯枪头

Ø 1.5mL，2mL 无菌低吸附离心管

相关设备

Ø 迷你离心机

Ø 漩涡振荡器

Ø 恒温水浴锅或金属浴锅

Ø 1000μL，100μL，10μL 移液枪

Ø 荧光定量 PCR 仪

Ø 生物安全柜

Ø 冷冻离心机

Ø 微孔板迷你离心机

【附录 5 无菌操作规范】

无菌操作规范

1、除高速离心机外，其他设备和耗材应放在无菌操作台中，保证无菌。

2、样本高速离心后，要对离心管喷酒精，并用棉球擦拭离心管外壁，同时更换干净的板架和新手套。

3、实验前用75%酒精擦净台面及四周，放好需用的实验器材及各种溶液，并用酒精棉球擦拭，更换干净的管架。

4、对着桌面，空间喷洒酒精，然后将超净工作台通风机打开，超净工作台和紫外灯打开 30～45 分钟，再将无菌室紫外灯打开 30～45 分钟后关闭，再通风 15 分钟。关闭紫外，拉开小一半隔离，用酒精棉球擦拭超净工作台桌面2遍，关上隔离。

5、进入无菌室操作前，双手在操作台内手臂部分用75%的酒精擦拭消毒。穿专用工作服、帽及拖鞋、口罩，应放在无菌室缓冲间，工作前经紫外线消毒后使用。

6、无菌室温度宜控制在 18～28℃，湿度在 45%～65%（温湿度计应该用无水的）。

7、从枪头盒中取出枪头时，尖部不能触及外露部位及离心管和管架边。

8、操作尽量在酒精灯前操作。打开离心管前，酒精灯灼烧镊子，待冷却后用镊子开关管盖。

9、操作中，不能在样品上方翻转瓶盖，袖口不能掠过样品上方。

10、实验完毕，清洁台面。

11、实验者在实验后用肥皂清洗双手。

12、换下的专用实验服，进行紫外线，一次性鞋套额帽子扔进垃圾桶。

13、用毕，再开紫外灯消毒 30分钟。

14、无菌室和缓冲间定期大扫除，保持整洁。

15、定期检查紫外灯灯管。每隔两周需用酒精棉球轻轻擦拭，除去上面灰尘和油垢，以减少紫外线穿透的影响。如灯管发黑，超过使用期限，及时更换紫外灯管。

2、注意事项

(1)工作台面上，禁止存放不必要的物品，以保证工作区域内的洁净气流不受干扰。

(2)禁止在工作台面上记录，工作时应尽量避免作明显扰乱气流的动作。(3)根据环境洁净度，每 3~6 个月将中效过滤器中的滤料拆下清洗。一般情况下，当无纺布滤料容纳尘埃较多、表面发黑时即可拆下进行清洗，或者予以更换。

(4)风机转速调至最大时，仍不能达到所需要的风速时（即风速≤0.2m/s）,则必须更换高效空气过滤器。