RNA-seq是研究特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA（包括mRNA和非编码RNA）的类型与表达的重要手段，一般的RNA-seq指的是狭义上的mRNA测序分析，已经广泛应用于农学、医学等领域。 目前，随着测序成本的不断降低和测序通量的不断提升，第二代测序技术凭借高准确性、高通量、高灵敏度和低运行成本等突出优势逐渐成为生物学研究者常用的手段。

样品要求

a. 样品类型：去蛋白并进行 D  ase 处理后的完整总 RNA；

b. 样品需求量（单次）：≥2 μg；

c. 样品浓度：≥100 ng/μl；

d. 样品纯度：OD260/280=1.8~2.2；RIN ≥8.0，28S:18S ≥1.0。

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交付结果

标准化分析内容：

有参考基因组序列的转录组：

1. 数据过滤质控及统计 

2. 与参考序列比对及统计、评估； 

3. 基因和转录本表达定量分析； 

4. 基因差异表达分析； 

5. 差异基因的功能富集分析； 

6. 差异基因层次聚类分析； 

7. 差异基因蛋白互作网络分析； 

8. SNP和InDel； 

9. 可变剪接分析 

10. 新转录本预测；

无参考基因组的转录组：

1.数据过滤质控及统计；

2.转录组denovo组装；

3.转录本功能注释；

4.ORF/CDS预测；

5.转录本表达定量分析；

6.基因差异表达分析；

7.差异基因的功能富集分析；

8.差异基因层次聚类分析；

9.SNP Calling； 
10.SSR开发

11.差异基因蛋白互作网络分析