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病理学常规染色：
常规组织切片基本为无色透明，在一般光镜下不易观察，因此要根据组织不同结构的特异性来选择不同的实验方法。苏木精—伊红染色法，简称HE染色法，病理技中最常用的染色法之一 。苏木精染液为碱性，使细胞核着紫蓝色；伊红为酸性，使细胞质着红色，HE染色法是组织学、病理学研究中使用最广泛的技术方法，用来观察组织的基本结构。

Masson染色：主要用途：用于胶原纤维和肌纤维的染色及鉴定；染色结果：胶原纤维呈蓝色、肌纤维呈红色、细胞核呈蓝黑色。

普鲁士蓝染色/铁染色：又称含铁血黄素染色，即经过稀酸处理后可以产生蓝色，常见于吞噬细胞内或间质内，主要显示三价铁盐。普鲁士蓝是非常经典的组织化学反应，是显示组织内三价铁的一种敏感、传统优良的方法，其染色原理为：三价铁离子被从蛋白质中被稀盐酸分离出来，生成不溶解的蓝色化合物，即普鲁士蓝。
染色结果：含铁黄素或三价铁呈蓝色，细胞核呈红色。

尼氏染色：即Nissl染色法，用来鉴定神经元胞体中的尼氏体，是最常用的神经细胞染色，在该染色中，尼氏小体清晰可见，可区分轴突和树突等。
染色结果：尼氏体呈紫色、细胞核呈蓝色。

天狼猩红染色：
用途：用来鉴定胶原纤维。
染色结果：应用偏光显微镜观察胶原纤维
I型胶原纤维：紧密排列，很强双折光性，纤维呈红色；
II型胶原纤维：弱双折光性，纤维呈多种颜色网状分布；
III型胶原纤维：弱双折光性，纤维呈绿色；
IIII型胶原纤维：弱双折光性，呈淡黄色；

LFB髓鞘染色：可对神经系统皮质脊髓进行染色。

甲苯胺蓝染色：可用来染肥大细胞，细胞核呈蓝色；肥大细胞胞质内含有肝素和组织胺等异色性物质，遇到甲苯胺蓝可呈异染性紫红色。

PAS染色：即过碘酸雪夫氏染色，糖原染色；用途：用来鉴定糖原和其它多糖物质；染色结果：糖原阳性染色结果呈紫红色，细胞核呈蓝紫色。

油红O染色：用途：用来脂肪组织中的脂肪染色；染色结果：脂肪呈红色，细胞核呈蓝色。

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