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原位杂交技术在染色体铺片的应用

原位杂交技术在染色体铺片的应用

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产品名称: 原位杂交技术在染色体铺片的应用

英文名称: Application of FISH

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近年,不少科技工作者将原位杂交组织细胞化学技术(ISHH)应用于细胞分裂中期(Metaphase)和分裂间期(Interphase)的染色体铺片上,利用标记的核苷酸探针与之进行杂交,可在光镜或电镜水平检测到不同的特异性的标记物。目前,原位杂交组织化学在染色体铺片的应用主要在三个方面:染色体的基因分配或基因图(Gene assignment)的研究、癌细胞或癌前组织的染色体异常的间期细胞遗传学分析研究和性染色体对胚胎的生前诊断。在依次介绍这些方法的应用以前,我们先简要介绍一个有关染色体的基本的知识和染色体铺片的制作方法。

一、有关染色体的基本知识及制片

(一)染色体的形态结构

体细胞的染色体是46个,23个,其中22对是常染色体,一对是性染色体。男性一对XY,女性为XX。染色体的形态随着细胞周期的不同而有所改变,在光学显微镜下所看到的染色体是细胞分裂中期染色体(metaphase chromsome)。

每个染色体含有两条染色单体,呈赤道状彼此分离,只有着丝粒处相连。根据着丝粒的位置分为三种类型,中部着丝粒型,亚中部着丝粒和端着丝粒型(图21-1)。

21-1 正常人体细胞的三种染色体
1
.中部着丝点染色体;2.近中部着丝点染色体;3.近端部着丝点染色体
1.
非显带染色体特征  分为七组

A组(13):为最大的具中部着丝粒染色体,这组染色体相互间很易区别。第1号和第2号染色体大小相似,唯第2号染色体为近中部着丝粒染色体。第3号染色体较12号染色体小,为中部着丝粒染色体。

B组(45):为大的具中部着丝粒染色体。2对染色体之间在形态和长度上较难区别。

C组(612号和X):为中等大小的具中部或近中部着丝粒染色体。这组染色体较难区分,其中第6711号和X染色体为中部着丝粒染色体,第891012号染色体为近中部着丝粒染色体。女性为2X染色体。男性只有1X染色体。

D组(1315号):为中等大小的具近端着丝粒染色体。在其短臂上有随体。与他组染色体有明显区别。但3对染色体之间较难区别。

E组(1618号):为小的具中部或近中部着丝粒染色体。第16号染色体为中部着丝粒染色体,第17号和18号染色体为近中部着丝粒染色体。不过,着丝粒位置第18号较第17号染色体更近端部。

F组(1920号):为更小的中部着丝粒染色体。2对染色体之间,形态上很难区别。

G组(2122号和Y):为最小的近端着丝粒染色体。第21号和22号染色体大小相似,且短臂上常连有随体。Y染色体常比第2122号染色体大、染色深。且无随体。Y染色体长臂2个染色单体比较靠拢,长臂末端也较模糊。

2G带染色体的特征

1号染色体:识别并不困难,但初学者易把长短臂颠倒。短臂的近侧1/2处有2个深带。远侧有一半几乎为浅染区;短臂共分3区。界标为近侧的深带(21带)和中段的深带(31带)。长臂近侧为一窄的浅带。中段和远侧段各有2条深带;长臂共分4区,界标为次缢痕远侧的浅带(21带)、中段的深带(31带)和远侧的深带(41带)。

2号染色体:短臂可见4条深带。中段的2条深带常互相靠近,表现为1 条深带;短臂共分2区,界标为1浅带(21带)。长臂可见47带,近侧着色甚浅,中段及远侧着色较深;长臂共分3区,界标为2个浅带(21带和31带)。

3号染色体:短臂近侧可见2条深带;远侧可见3 条深带,其中远端的1条带较窄,染色浅;短臂分为2区,界标为1浅带(21带),长臂近侧和远侧各有1条较宽的深带:好的标本近侧深带可分为2条深带,远侧深带可分为34条深带;长臂分为2区,界标为1浅带(21带)。长臂深带宽度略大于短臂深带。

4号染色体:短臂有12条深带,只1区。长臂有均匀分布的4条深带;长臂分3区;界标为2浅带(21带和31带)。

5号染色体:短臂有1条深带,只1区。长臂有5条深带,中段的3条深带常靠近;长臂分3区,界标有1深带(21带)和1浅带(31带)。

6号染色体:短臂近侧有1宽的浅带,远侧为1深带;短臂分2区,界标为1浅带(21带)。

7号染色体:短臂有23条深带,近末端带着色很深;短臂分2区,界标为1深带(21带)长臂有3条深带,近侧和中部的2条带较深;长臂分3区,界标为2深带(21带和31带)。

8号染色体:短臂有2条深带,远侧深带较近侧深带着色深;短臂分2区,界标为1浅带(21带)。长臂有34条深带,远中的深带着色较深;长臂分2区,界标为1深带(21带)。

9号染色体:短臂有12条深带;短臂分2区,界标为1深带(21带)。长臂2条深带。长臂分3区,界标为2深带(21带和31带)。

10号染色体:短臂有2条深带,近侧较近侧深带着色浅;短臂只1区。长臂有3条深带,近侧深带着色更深;长臂分2区,界标为1深带(21带)。

11号染色体:短臂有12条深带;短臂只1区。长臂有2条深带,在近侧深带与着丝粒之间有1宽的浅带;长臂为2区,界标为1浅带(21带)。

12号染色体:短臂有1条深带;短臂只1区。长臂有3条深带,中间的1条深带宽,近侧深带与着丝粒的距离较第11号染色体近;长臂分2区,界标为1深带(21带)。

13号染色体:长臂有4条深带,中间2条深带宽;长臂分3区,界标为中间的2条深带(21带及31带)。

14号染色体:长臂有45条深带,近侧的第2条带和远侧的带着色更深;长臂分3区,界标为2条深带(21带和31带)。

15号染色体:长臂有4条深带,近侧的第2条带较宽;长臂分2区,界标为1深带(21带)。

16号染色体:短臂有12条深带,短臂只1区。长臂有2条深带,近中部深带明显;长臂分2区,界标为1深带(21带)。

17号染色体:短臂有1深带;只1区。长臂12深带,远侧深带较宽,在深带与着丝粒之间有1 宽的浅带;分2区,界标为浅带(21带)。

18号染色体:短臂为1浅带区。长臂有2条深带;为2区,界标是1浅带(21带)。

19号染色体:着色最浅。着丝粒周围为深带。短臂和长臂均为1区。

20号染色体:短臂有1深带,较宽;短臂和长臂均为1区。长臂有1深带,较宽。

21号染色体:最小的1个染色体。长臂紧按着丝粒处有1深带,较宽;长臂为2区,界标为1深带(21带)。

22号染色体:较21号色体长,长臂紧接着丝粒处有1深带,较窄。短臂和长臂均为1区。

X染色体:短臂中部有1条深带;分2区,界标是深带(21带)。长臂有4条深带,其中近槽深带最宽;分2区,界标是近侧深带(21带)。

Y染色体:长臂远侧半色着深,为1深带;短臂和长臂均为1区。

现在国内流行一种辨认G带每个染色体的口诀,稍加修改如下:

一秃二蛇三蝶飘,四象鞭炮五黑腰;

六号短空小白脸,七上八下九苗条;

十号长臂近带好,十一低来十二高;

十三十四十五号,三个长臂一二一;

十六长臂缢痕大,十七长臂带脚镣;

十八人小肚皮大,十九中间一黑腰;

二十头重脚底轻,二十一带宽身体小;

二十二带小身体大,Y长一宽近末端;

X短臂一、长臂三,中间象个工字般。

(二)染色体G显带技术

1.原理  染色体的化学成份是核酸和蛋白质两部分。核酸以DNA为主,蛋白质有组蛋白和非组蛋白两种。因此染色体经蛋白水解酶类物质处理后,蛋白质已被水解而使DNA分子中碱基暴露,由于碱基中G/CA/T组合的比例不同,对染料结合的程度不一,如这一段A/T碱基的成份多,则Giemsa染料易与它结合成深染;另一段G/C碱基的成份多,则Giemsa染料不易与其结合,结果成淡染,由于整条染色体上A/TG/C的分布不匀,这样在染色体上呈现出深浅不一的条纹或者称带纹,该技术用Giemsa染色,故其带型称为G带。

2.操作过程

1)按常规染色体技术制片。

2)制好的染色体玻片,在80℃烘箱中,烘烤2h,置于室温。

34℃冰箱PBS5min

44℃冰箱PBS缓冲液含胰蛋白酶终浓度0.025%,消化10min

5)蒸馏水洗净胰酶。

6Giemsa染色20min

7)蒸馏水洗净染色液,晾干镜检。

4℃低温胰酶处理片子,其优点是:时间较长,易掌握。配制1次试剂可用12个月。

(三)高分辨染色体G带技术

1.原理常规的G带显带技术,在人类染色体中仅观察到320450条带纹,对于一些染色体细微结构异常的识别是不够的。

氨甲碟呤抑制二氢叶酸还原酶,阻止叶酸转变为四氢叶酸,从而干扰了脱氧胸腺嘧啶核苷酸的合成,阻止了DNA的复制,使细胞被阻止在S期内。胸腺嘧啶核苷解除氨甲喋呤的作用,让被阻滞的细胞同时开始进行DNA复制,进而同步分裂;放线菌素D可增加染色体的长度,能显示更多的亚带。放线菌素D与核酸相互作用:插入脱氧鸟嘌呤核苷酸和脱氧胞啶核苷酸之间,使DNA变长;能与染色体缩短有关的特殊蛋白和DNA结合,因此,抑制了染色体正常的收缩过程。秋水仙胺抑制纺垂丝的形成,可以得到较多的晚前期、前中期、早中期的分裂相。这样染色体带纹可增加到500850条,甚至可达12002000条之多。这一步对于研究较细小的染色体缺陷的基因定位,具有很大的意义。

2.材料和方法

14ml培养液(为从日本进口的RPMI 1640或从美国进口的F10液)虽自制的小牛血清1ml。每ml加青、链霉素各100单位,pH=7.2

2)每瓶培养液内,另加自制的PHA或重庆产的PHA2.5mg

3)取外周血2ml,分别装入含培养液的4个培养瓶内。

437℃孵育箱内培养72h

5)加入氨甲喋呤,最终浓度10-7mol/L,继续培养17h

6)用不含血清的培养液冲洗两次后,将上清液吸出,再加入含胸腺嘧啶核苷(最终浓度为10-5mol/L)的培养液,继续培养3h

7)再加入放线菌素D,最终浓度为3μg/ml,培养2h

8)加秋水仙胺,最终浓度为0.03 μg/ml,培养2h

9)按常规染色体技术制片。

10)按一般常用的G带显带技术,显示带纹。

3.注意事项

1)高分辨染色体,重叠多,应增加固定次数和固定时间,可置于4℃冰箱存放24h后制片,用高距离滴片,以使染色体分散开。

2)细胞培养液同步化后,如果用5--2脱氧尿核苷(5-bromodeoxyuridine, BrdU),则需加黑物包装进行暗培养。

(四)外周血培养及染色体制片技术

1.国内应用的外周血培养染色体技术

1)原理:外周血染色体制备是目前应用最广泛的细胞遗传学诊断技术,亦是基本的实验技术,由于取材容易,培养过程比较简单,短期内可以得到结果,所以其实用价值很高。

血液中含有红、白两类细胞,它们均是处于未分裂的间期细胞。红细胞没有核,无分裂能力;白细胞类虽有细胞核存在,但是外周血中处于休止期。植物血球凝集素(简称PHA)能促使淋巴细胞和单核细胞转化为具有分裂作用的母细胞。染色体只有在细胞分裂中期时最典型。秋水仙素类药的药物能抑制纺锤丝的形成,使细胞分裂停止于中期,低渗处理使细胞膨胀,细胞膜破裂,染色体分散,这样就可便于分析。

简意流程图:

2)操作过程

采血:无菌干针筒从静脉取血12ml,用肝素抗凝(约每毫升全血内含肝素100单位)。

培养液配制:RPMI 1640       4ml

小牛血清       1ml

1%PHA(自制)0.2ml

调节 pH7.4后置于-20℃冰箱

标本接种:每5ml培养液加入抗凝全血0.5ml

培养细胞:将接种好的培养瓶置于37℃恒温箱中培养72h

阻止分裂:培养至68h,加秋水仙素,最终浓度0.02μl/ml,摇匀后置于37℃恒温箱中继续培养4h

收获:培养物混合后,置于10ml离心管内,离心10min1000/min),去上清液。留下培养物。

低渗处理:低渗液可用0.56%KCl(或0.075mol/L KCl57ml,用吸管打散沉淀物,置于37℃水浴箱中保温20min,然后加入固定液(3份甲醇:1份冰乙酸)1ml用吸管打匀,预固定12min

离心:1000/min离心10min

固定:吸去上清液,留下沉淀加上述固定液68ml,用吸管将沉淀物打散,固定30min后离心,1000/min离心10min,取出吸去上清液留下沉淀。

重复上述固定离心1次。

标本制作:最后1次固定、离心后吸去上清液,留下沉淀再加少量新鲜固定液约0.3ml打散细胞悬浮液即可进行制片。制片之前先将载玻片经清洁液洗净处理后,置于冰箱内制成冰片。取冰片1张滴上23滴细胞悬液。利用冰片的表面张力关系使液体迅速向玻片四周散开,与此同时用嘴轻轻吹向滴片处,以助其更快散开,然后在酒精灯火上通过78次后,自然干燥或烤干均可。

染色:Giemsa染液1份和pH7.4磷酸缓冲液9份,混合后,染色20min,蒸馏水洗去余下染液,晾干,镜检观察。

3)注意事项

无菌操作是关键。培养液不得污染。

所用药品不得失效,特别是PHA,既要使淋巴细胞转化,又不能过量。

小牛血清优质、无菌。

秋水仙清素低浓度46h效果最佳,过量则染色体易收缩。

固定液和Giemsa染液要求新鲜配用。

培养时间72h较好。

4)各种物品清洗与消毒

玻璃器皿用后,立即用自来水冲洗,再用洗衣粉刷洗,然后用自来水冲洗。待干,泡入清洁液2448h,取出,自来水冲洗,再用双蒸水冲洗,干后备用。

接触洗液时,带上橡皮手套,围裙等防护品。

常用清洁液配制:

重铬酸钾25g

200ml

浓硫酸1000ml

先将重铬酸钾在水中溶解,然后慢慢加入浓硫酸,边加边搅拌,防止过度发热。使用36月后检查,若变绿表示失效。

④G5G6漏斗的处理:水洗净、晾干,于浓硫酸泡(或洗液中泡)24h,再用蒸馏水冲洗至加入1% BaCl2滴无白色沉淀为止。包装消毒,1520min

5)橡皮塞的处理

新的橡皮塞洗后,先用0.5N NaOH煮沸15min,再用0.5N HCl煮沸15min,流水冲洗10min,用双蒸水泡24h,双蒸水冲洗,晾干,1520min高压灭菌。

6)金属器械清洗

先用纱布或纸擦去防锈油,然后用洗涤液清洗,再用清水或蒸馏水洗净,擦干或烘干备用。

2.外周血细胞培养法(Bhatt B and McGee JOD,1990

1)收集静脉血(无菌),加肝素抗凝(20单位/ml);

2)加0.8ml全血入每个培养瓶(含10ml培养液),37℃培养72h

培养液配制:RPMI 76ml(Gibco,Cat.No.041-1875M)

小牛血清   20ml

PHA       2.0ml

3)加100μl Brdu于培养瓶中,37℃再孵育1617h

4)离心(1200rpm8min,弃去上清液,沉淀中加入10ml RPMI 1640培养液,混匀;

5)重复步骤(4);

6)沉淀中加入10ml新配制的完全培养液(含2.5μg/ml胸腺嘧啶),重新置于37℃孵育67h

7)在收获培养细胞前1530min,可加Colcemid,但当同时应用BrdU时这就并非十分必要。因为BrdU是胸腺嘧啶核苷的类似物,能使染色体在富含异染色质处断裂分解,从而使显带明显;

81200rpm离心培养细胞,弃去上清液,加入1ml 0.56% KCl(事先预热至37℃),继续加入0.56% KCl使总容量达到10ml,在37℃孵育10min

9)如上述离心,弃去上清液,在沉淀的细胞内加入新鲜的冷固定剂,(甲醇:冰醋酸=31,新鲜配制,保存在冰上),置冰上至少20min

10)重复步骤(934次,直至细胞悬液清洁无色;

11)可较长期保存在冰的固定剂内(-20℃)或再离心后加入0.5 1.0ml新鲜固定剂,置于冰上;

12)玻璃载片放在Decon(清洁液)或其它的清洁液内过夜,次日用自来水冲洗,继之蒸馏水漂洗,在6075℃干燥,然后把载片孵育在2%丙酮液内,室温,60min。自来水冲洗,再在6075℃干燥;

13)每张载片上加10μl的细胞混悬液,空气干燥,在24h后可应用于杂交实验,也可保存在-4℃8周之久(试剂配制法见附录四)。

二、应用ISHH技术对染色体制片、基因分配(Chromosomal assignment of genes)的研究

(一)基本原理

染色体上基因位置分配的研究,又叫染色体图的研究,包括基因名称、基因在染色体的位置及与相邻基因的距离及其核酸序列的研究。研究基因图的方法包括家系的连锁分析法、体细胞杂交法、重组DNA技术和原位杂交法。果蝇的线形基因图和大肠杆菌、T4噬菌体两者的环状基因图都已绘成,目前正致力于人类基因图的绘制。人类基因约有5万~10万个,根据第八次国际人类基因定位工作会议,已定位的人类基因总数达1479个。

ISHH技术对染色体基因图的研究,是用同位素或生物素、地高辛标记的核酸探针,直接同中期的染色体铺片行杂交。早期的研究是用于重复序列DNA的定位,如编码核糖体的基因18S28S核糖体RNA定位于第1315号染色体和第2122号染色体短臂次缢痕区。5S核糖体RNA定位于第1号染色体上长臂的远侧Iq42Iq43。近年已能进行单拷贝基因的定位,如胰岛素基因定位于IIP 15上、C-mos原癌基因定位于Sq22上、N-ras原癌基因定位于IPI34。在染色体11的短臂上,利用ISHH技术证明4个基因依次排列,从短臂的远端依次为胰岛素、β-球蛋白、HRASIPTH

(二)操作步骤(Bhatt and MCGee, 1990

在前面已介绍了制备血培养染色体铺片的方法。下面介绍的是在染色体制片上用免疫金银染色法进行原位杂交的基因定位显示、结合Giemsa染色显带技术的操作步骤。

1.移除内源性RNA

1)加100μl RNA酶溶液,覆以盖玻片,放在有少许2×SSC溶液的湿盒内孵育,37℃60min

2)在2×SSC溶液内移除盖玻片,以2×SSC2×3min

3)等级酒精系列脱水,10%50%70%90%100%,各1min,各1min。空气干燥。

2.探针标记和纯化用缺口平移法将生物素11-dUTP标记在DNA核酸探针上。

3.变性与杂交

20100ng生物素标记探针到杂交液中,加入5μl 20mg/ml人或鲱鱼精子DNA,总容量为3040μl,离心5s,混匀后,滴于染色体铺片,覆以盖玻片,盖片四周以橡皮泥封固。放入盛2×SSC溶液温盒内75℃78min,使之变性,继之于37℃孵育16h

4.杂交后漂洗2×SSC溶液内移除盖玻片,将载片浸入含50%甲酰胺的2×SSC溶液内,pH7.2,20min,42℃。然后作下列程序漂洗

溶液    漂洗时间     温度

            2×SSC     20min       42℃

            1×SSC     20min       室温