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技术介绍 | 非靶标代谢流分析

作者:上海阿趣生物科技有限公司 2021-12-16T10:12 (访问量:5440)

经典代谢组学可以反映机体代谢物的变化及可能被激活的通路,但同一代谢物可能参与多条代谢通路而其丰度不发生变化,代谢网络是复杂并且动态变化的,而代谢组学仅能提供静态的代谢物丰度信息,因此仍存在局限性,代谢流分析技术则可以很好地弥补这一局限。

为了深入了解细胞代谢过程,我们采用各种组学工具包括基因组学、宏基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学进行分析。但由于这些组学技术目前无法充分反映转录后调控、酶活性及细胞过程。于是提出了代谢流组学(Fluxomics)来全面研究所有代谢物的流率(flflux rates),这样就可以很好的描述细胞在生理过程中的代谢活性。


非靶标代谢流可以研究代谢流量随时间的动态变化规律,不限于特定的代谢通路,对流经代谢途径的代谢流量组进行分析,能够很好的解释代谢物在生物途径中如何变化,将代谢组学的研究提升到更高的水平和层次。BIOTREE非靶代谢流解决方案:无偏向性的检测所有带同位素标记的代谢物,广泛筛选同位素标记的代谢物参与的代谢途径或基因敲除前、后代谢速率变化。




技术优势


• 分辨率高:可以分辨同位素标记和非标记代谢物

与靶标代谢流相比,非靶标代谢流不限于特定的代谢通路,可对标记的代谢物进行流向分析



技术路线



技术参数


• 样本要求

细胞 :1×107 cells/sample


• 生物学重复

样本数量: 植物和微生物n≥6,动物样本n≥10,临床样本n≥30,所有重复样本独立分析

其他种类的样品在收集之前请联系公司销售工程师


• 检测平台

UHPLC-Thermo Fisher QE HFX / UHPLC-Thermo Fisher QE focus


• 常规项目周期

实验检测:25个自然日

数据分析:5个自然日



应用方向


非靶标代谢流分析可以广泛应用于生命科学和医药研究中,包括细胞代谢调控、代谢新通路、疾病代谢机制、药物新靶标发现与确证、药物药效及毒性评价、疾病诊断或预后生物标志物、药物代谢组学、精准用药等领域。

• 基因工程:提高基因工程菌目标代谢产物;基因改造前后的代谢功能变化

• 疾病机理:揭示肿瘤代谢抑制剂个性化治疗机制;疾病发生发展过程早期诊断的标志物

• 代谢重编程:炎症性巨噬细胞免疫代谢重编程机制;植物叶绿体代谢重编程机制



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